Agnes Nokshiqi a grandi à Skopje en Macédoine dans une famille d’artistes. Elle a tourné son premier film à Skopje à l’âge de six ans. Elle est diplômée de la Faculté d’art dramatique de Skopje en 1998. Agnes travaille avec différents média comme la vidéo, la photographie et la performance. Elle enseigne à la Faculté des Arts de l’Université de Pristina au Kosovo.